MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 43995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013416	TAT	2	6	196757	196762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866929
4002	NC_013416	CT	3	6	196795	196800	0 %	50 %	0 %	50 %	261866929
4003	NC_013416	TGA	2	6	196849	196854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866929
4004	NC_013416	ATT	2	6	196864	196869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866929
4005	NC_013416	TGAA	2	8	196872	196879	50 %	25 %	25 %	0 %	261866929
4006	NC_013416	CTA	2	6	196925	196930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866929
4007	NC_013416	GTT	2	6	196931	196936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866929
4008	NC_013416	GTT	2	6	196989	196994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_013416	TAAAT	2	10	197015	197024	60 %	40 %	0 %	0 %	261866930
4010	NC_013416	GAA	2	6	197031	197036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866930
4011	NC_013416	A	6	6	197097	197102	100 %	0 %	0 %	0 %	261866930
4012	NC_013416	ATT	2	6	197157	197162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_013416	CTT	2	6	197268	197273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_013416	CA	3	6	197350	197355	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_013416	T	7	7	197589	197595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_013416	ACA	2	6	197709	197714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_013416	ATTT	2	8	197722	197729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_013416	T	6	6	197738	197743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_013416	CAT	2	6	197753	197758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_013416	TAA	2	6	197762	197767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_013416	ATAA	2	8	197929	197936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_013416	C	6	6	197950	197955	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4023	NC_013416	TAT	2	6	198050	198055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_013416	ATT	2	6	198115	198120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_013416	TAAAA	2	10	198130	198139	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_013416	TATT	2	8	198181	198188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_013416	ATT	2	6	198259	198264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866931
4028	NC_013416	GAA	2	6	198473	198478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866931
4029	NC_013416	GAC	2	6	198487	198492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866931
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4031	NC_013416	TTC	2	6	198587	198592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866931
4032	NC_013416	AAT	2	6	198609	198614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866931
4033	NC_013416	GGT	2	6	198680	198685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866931
4034	NC_013416	TCA	2	6	198720	198725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_013416	GAT	2	6	198734	198739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_013416	TAC	2	6	198760	198765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_013416	GAA	3	9	198804	198812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_013416	AAG	2	6	198963	198968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866932
4039	NC_013416	TAA	2	6	198996	199001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866932
4040	NC_013416	GAT	2	6	199041	199046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866932
4041	NC_013416	TAA	2	6	199071	199076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866932
4042	NC_013416	TGC	2	6	199113	199118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866932
4043	NC_013416	TAC	2	6	199119	199124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866932
4044	NC_013416	TTC	2	6	199269	199274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866932
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4047	NC_013416	T	6	6	199503	199508	0 %	100 %	0 %	0 %	261866933
4048	NC_013416	AAC	2	6	199659	199664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866933
4049	NC_013416	TTCG	2	8	199668	199675	0 %	50 %	25 %	25 %	261866933
4050	NC_013416	CTT	2	6	199676	199681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866933
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4052	NC_013416	TGC	2	6	199803	199808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866933
4053	NC_013416	GGA	2	6	199848	199853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261866933
4054	NC_013416	CAT	2	6	199859	199864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866933
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4058	NC_013416	ACC	2	6	199986	199991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866933
4059	NC_013416	CCG	2	6	200077	200082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866933
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4063	NC_013416	T	6	6	200318	200323	0 %	100 %	0 %	0 %	261866933
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4072	NC_013416	GAG	2	6	200653	200658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261866933
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4082	NC_013416	ATCAA	2	10	201046	201055	60 %	20 %	0 %	20 %	261866933
4083	NC_013416	TCT	2	6	201073	201078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866933
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4092	NC_013416	TA	3	6	201649	201654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_013416	GCT	2	6	201865	201870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866934
4094	NC_013416	ACG	2	6	201900	201905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866934
4095	NC_013416	ACC	2	6	201942	201947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866934
4096	NC_013416	ACG	2	6	201951	201956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866934
4097	NC_013416	CTT	2	6	202016	202021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866934
4098	NC_013416	T	6	6	202080	202085	0 %	100 %	0 %	0 %	261866934
4099	NC_013416	ATG	2	6	202096	202101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866934
4100	NC_013416	GTT	2	6	202160	202165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866934
4101	NC_013416	TAC	2	6	202169	202174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866934
4102	NC_013416	GAC	2	6	202175	202180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866934
4103	NC_013416	CTTA	2	8	202321	202328	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4104	NC_013416	ACC	2	6	202460	202465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	350234643
4105	NC_013416	CCG	2	6	202509	202514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350234643
4106	NC_013416	T	6	6	202583	202588	0 %	100 %	0 %	0 %	350234643
4107	NC_013416	AC	3	6	202603	202608	50 %	0 %	0 %	50 %	350234643
4108	NC_013416	TTG	2	6	202705	202710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350234643
4109	NC_013416	A	7	7	202716	202722	100 %	0 %	0 %	0 %	261866936
4110	NC_013416	TAA	2	6	202731	202736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866936
4111	NC_013416	A	6	6	202744	202749	100 %	0 %	0 %	0 %	261866936
4112	NC_013416	TGT	2	6	202750	202755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866936
4113	NC_013416	TTA	2	6	202820	202825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866936
4114	NC_013416	TTGC	2	8	202842	202849	0 %	50 %	25 %	25 %	261866936
4115	NC_013416	CAA	2	6	202892	202897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_013416	ATTGTC	2	12	202908	202919	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4117	NC_013416	TTC	2	6	203071	203076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866937
4118	NC_013416	TCT	2	6	203114	203119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866937
4119	NC_013416	ATC	2	6	203120	203125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866937
4120	NC_013416	CGC	2	6	203139	203144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866937
4121	NC_013416	TCA	3	9	203247	203255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_013416	TTTGAA	2	12	203395	203406	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_013416	AATA	2	8	203442	203449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_013416	GAA	2	6	203485	203490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_013416	AGCGA	2	10	203556	203565	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4375	NC_013416	AT	3	6	215057	215062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4376	NC_013416	TGA	2	6	215154	215159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4378	NC_013416	A	6	6	215215	215220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4379	NC_013416	A	6	6	215300	215305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4380	NC_013416	TAC	2	6	215316	215321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4382	NC_013416	TGA	2	6	215351	215356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4493	NC_013416	ACAA	2	8	220737	220744	75 %	0 %	0 %	25 %	261866957
4494	NC_013416	TGG	2	6	220836	220841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866957
4495	NC_013416	TTG	2	6	220896	220901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866957
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4497	NC_013416	TCA	2	6	220951	220956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866957
4498	NC_013416	GCA	2	6	220981	220986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866957
4499	NC_013416	GGC	2	6	221032	221037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866957
4500	NC_013416	GCG	2	6	221048	221053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866957

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